Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms