Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RRBP1Q9P2E9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms