Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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