Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRIP3Q9NQ35 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms