Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRA1Q9HD15 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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