Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms