Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PIF1Q9H611 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIF1Q9H611 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms