Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFDQ9GZP0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms