Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC2Q9BYS8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC2Q9BYS8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms