Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF4Q9BUZ4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms