Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms