Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD2Q9BTF0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD2Q9BTF0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms