Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM79Q9BSE2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM79Q9BSE2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms