Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms