Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF3RQ99062 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms