Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 353.1 ms