Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EP400Q96L91 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms