Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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RABGGTAQ92696 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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RABGGTAQ92696 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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RABGGTAQ92696 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGGTAQ92696 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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