Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113Q902F9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms