Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKL3Q8IVW4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKL3Q8IVW4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKL3Q8IVW4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKL3Q8IVW4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKL3Q8IVW4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKL3Q8IVW4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms