Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTF1AQ7RTS3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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