Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HECW1Q76N89 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms