Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms