Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms