Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT80Q6KB66 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms