Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms