Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BROXQ5VW32 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BROXQ5VW32 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BROXQ5VW32 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BROXQ5VW32 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BROXQ5VW32 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BROXQ5VW32 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BROXQ5VW32 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BROXQ5VW32 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms