Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRPF38BQ5VTL8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRPF38BQ5VTL8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms