Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms