Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms