Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRMS1LQ5PSV4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms