Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHC2Q5JST6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFHC2Q5JST6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFHC2Q5JST6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms