Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF2Q5BJF6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms