Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms