Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KLHL40Q2TBA0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms