Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms