Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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