Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTC4SQ16873 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LTC4SQ16873 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LTC4SQ16873 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LTC4SQ16873 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LTC4SQ16873 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LTC4SQ16873 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LTC4SQ16873 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LTC4SQ16873 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LTC4SQ16873 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms