Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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