Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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