Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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