Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN9AQ15858 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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