Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RAB35Q15286 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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RAB35Q15286 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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RAB35Q15286 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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RAB35Q15286 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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RAB35Q15286 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB35Q15286 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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