Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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BRD3Q15059 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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BRD3Q15059 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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BRD3Q15059 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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