Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMD6Q15008 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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