Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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