Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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