Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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