Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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