Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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